%0 Journal Article %T Molecular diagnosis of PIK3CA-related overgrowth spectrum (PROS) in 162 patients and recommendations for genetic testing. %+ Centre de génétique - Centre de référence des maladies rares, anomalies du développement et syndromes malformatifs (CHU de Dijon) %+ Lipides - Nutrition - Cancer [Dijon - U1231] (LNC) %+ Service de pédiatrie (CHU de Dijon) %+ Hôpital Morvan - CHRU de Brest (CHU - BREST ) %+ Hôpital Européen Georges Pompidou [APHP] (HEGP) %+ Service de Génétique Médicale [CHU Necker] %+ Centre Hospitalier Intercommunal de Créteil (CHIC) %+ Centre Hospitalier Régional Universitaire de Tours (CHRU Tours) %+ Service de génétique [Tours] %+ Laboratoire Histologie Embryologie Cytogénétique [CHU Necker] %+ Service de dermatologie [Nantes] %+ Centre Hospitalier Régional Universitaire [Montpellier] (CHRU Montpellier) %+ Service de Génétique Médicale [Lille] %+ Service de Dermatologie et Allergologie [CHRU Nancy] %+ Service de Dermatologie [Nice] %+ Département de génétique médicale, maladies rares et médecine personnalisée [CHRU Montpellier] %+ Groupe Hospitalier de l'Institut Catholique de Lille (GHICL) %+ Hospices Civils de Lyon (HCL) %+ Laboratoire de Diagnostic Génétique [CHU Strasbourg] %+ Service de Génétique Médicale [CHU Clermont-Ferrand] %+ Cellules Souches, Plasticité Cellulaire, Médecine Régénératrice et Immunothérapies (IRMB) %+ Service de génétique [Rouen] %+ Génétique du cancer et des maladies neuropsychiatriques (GMFC) %+ CHU Trousseau [Tours] %+ Service de génétique médicale - Unité de génétique clinique [Nantes] %+ Service de Génétique [CHU La Réunion] %+ Centre Hospitalier Universitaire de Nîmes (CHU Nîmes) %+ Laboratoire Maladies Rares: Génétique et Métabolisme (Bordeaux) (U1211 INSERM/MRGM) %+ Centre Hospitalier Universitaire d'Angers (CHU Angers) %+ AP-HP - Hôpital Antoine Béclère [Clamart] %+ Unité de génétique médicale et oncogénétique [CHU Amiens Picardie] %+ Centre Hospitalier Universitaire de Toulouse (CHU Toulouse) %+ Centre de référence Déficiences Intellectuelles de Causes Rares [CHU Pitié-Salpétrière] %+ Centre Hospitalier Universitaire de La Réunion (CHU La Réunion) %+ Centre Hospitalier Lyon Sud [CHU - HCL] (CHLS) %+ Centre de recherche en neurosciences de Lyon - Lyon Neuroscience Research Center (CRNL) %+ Centre Hospitalier Universitaire de Saint-Etienne (CHU de Saint-Etienne) %+ Département de génétique [Robert Debré] %+ Service de Dermatologie (CHU de Dijon) %+ Laboratoire de cytogénétique (CHU de Dijon) %A Kuentz, Paul %A Saint-Onge, Judith %A Duffourd, Yannis %A Courcet, Jean-Benoît %A Carmignac, Virginie %A Jouan, Thibaut %A Sorlin, Arthur %A Abasq Thomas, Claire %A Albuisson, Juliette %A Amiel, Jeanne %A Amram, Daniel %A Arpin, Stéphanie %A Attie-Bitach, Tania %A Bahi-Buisson, Nadia %A Barbarot, Sébastien %A Baujat, Genevieve %A Bessis, Didier %A Boccara, Olivia %A Bonniere, Maryse %A Boute, Odile %A Bursztejn, Anne-Claire %A Chiaverini, Christine %A Cormier-Daire, Valérie %A Coubes, Christine %A Delobel, Bruno %A Edery, Patrick %A El Chehadeh, Salima %A Francannet, Christine %A Genevieve, David %A Goldenberg, Alice %A Haye, Damien %A Isidor, Bertrand %A Jacquemont, Marie-Line %A Khau van Kien, Philippe %A Lacombe, Didier %A Martin, Ludovic %A Martinovic, Jelena %A Maruani, Annabel %A Mathieu-Dramard, Michèle %A Mazereeuw-Hautier, Juliette %A Michot, Caroline %A Mignot, Cyril %A Miquel, Juliette %A Morice Picard, Fanny %A Petit, Florence %A Phan, Alice %A Rossi, Massimiliano %A Touraine, Renaud %A Verloes, Alain %A Vincent, Marie %A Vincent-Delorme, Catherine %A Whalen, Sandra %A Willems, Marjolaine %A Marle, Nathalie %A Lehalle, Daphne %A Thevenon, Julien %A Thauvin-Robinet, Christel %A Olivier-Faivre, Laurence %A Vabres, Pierre %A Riviere, Jean-Baptiste %< avec comité de lecture %@ 1098-3600 %J Genetics in Medicine %I Nature Publishing Group %V 19 %N 9 %P 989-997 %8 2017-09 %D 2017 %R 10.1038/gim.2016.220 %M 28151489 %K PIK3CA %K Molecular diagnosis %K Mosaicism %K Next-generation sequencing %K PIK3CA related overgrowth spectrum %Z Life Sciences [q-bio]/GeneticsJournal articles %X Postzygotic activating mutations of PIK3CA cause a wide range of mosaic disorders collectively referred to as PIK3CA-related overgrowth spectrum (PROS). We describe the diagnostic yield and characteristics of PIK3CA sequencing in PROS.METHODS:We performed ultradeep next-generation sequencing (NGS) of PIK3CA in various tissues from 162 patients referred to our clinical laboratory and assessed diagnostic yield by phenotype and tissue tested.RESULTS:We identified disease-causing mutations in 66.7% (108/162) of patients, with mutant allele levels as low as 1%. The diagnostic rate was higher (74%) in syndromic than in isolated cases (35.5%; P = 9.03 × 10-5). We identified 40 different mutations and found strong oncogenic mutations more frequently in patients without brain overgrowth (50.6%) than in those with brain overgrowth (15.2%; P = 0.00055). Mutant allele levels were higher in skin and overgrown tissues than in blood and buccal samples (P = 3.9 × 10-25), regardless of the phenotype.CONCLUSION:Our data demonstrate the value of ultradeep NGS for molecular diagnosis of PROS, highlight its substantial allelic heterogeneity, and confirm that optimal diagnosis requires fresh skin or surgical samples from affected regions. Our findings may be of value in guiding future recommendations for genetic testing in PROS and other mosaic conditions %G English %L hal-01560452 %U https://u-bourgogne.hal.science/hal-01560452 %~ UNIV-ST-ETIENNE %~ UNIV-NANTES %~ UNIV-BOURGOGNE %~ HCL %~ CNRS %~ UNIV-LYON1 %~ APHP %~ UNIV-STRASBG %~ CHLS %~ UNAM %~ COMUE-NORMANDIE %~ LNC-UMR866 %~ AGREENIUM %~ LNC-GAD %~ BS %~ UNIV-MONTPELLIER %~ SITE-ALSACE %~ UNIROUEN %~ CHU-UNIV-PARIS5 %~ SORBONNE-UNIVERSITE %~ SU-INF-2018 %~ SU-MEDECINE %~ SU-MED %~ CHU-CLERMONTFERRAND %~ UDL %~ UNIV-LYON %~ SU-TI %~ ALLIANCE-SU %~ CRNL %~ GENDEV_CRNL %~ NANTES-UNIVERSITE %~ UNIV-NANTES-AV2022 %~ UM-2015-2021 %~ UNIV-CATHOLILLE %~ ICL %~ TEST3-HALCNRS %~ INSTITUT-AGRO