National sentinel surveillance of transmitted drug resistance in antiretroviral-naive chronically HIV-infected patients in France over a decade: 2001-2011
Diane Descamps
(1)
,
Lambert Assoumou
(2)
,
Marie-Laure Chaix
(3)
,
Antoine Chaillon
(4)
,
Sophie Pakianather
(2)
,
Alexis de Rougemont
(5, 6, 7, 8)
,
Alexandre Storto
(1)
,
Georges Dos Santos
,
Anne Krivine
(9)
,
Constance Delaugerre
(10)
,
Brigitte Montes
(11)
,
Jacques Izopet
(12)
,
Charlotte Charpentier
(13)
,
Marc Wirden
(14)
,
Anne Maillard
(15)
,
Laurence Morand-Joubert
(16)
,
Coralie Pallier
(17)
,
Jean-Christophe Plantier
(18)
,
Jérô Me Guinard
,
Catherine Tamalet
(19)
,
Jacqueline Cottalorda
(20)
,
Anne-Geneviève Marcelin
,
Delphine Desbois
(21)
,
Cécile Henquell
(22)
,
Vincent Calvez
(23)
,
Francoise Brun-Vézinet
,
Bernard Masquelier
,
Dominique Costagliola
,
E. Lagier
,
C. Roussel
(24)
,
H. Le Guillou-Guillemette
(25)
,
C. Alloui
,
D. Bettinger
(26)
,
G. Anies
,
S. Reigadas
(27)
,
P. Bellecave
(27)
,
P. Pinson-Recordon
,
H. Fleury
,
S. Vallet
(28)
,
M. Leroux
(29)
,
J. Dina
(30)
,
A. Vabret
(31)
,
J. Poveda
,
A. Mirand
(32)
,
M. Bouvier-Alias
(17)
,
C. Noël
(33)
,
G. dos Santos
,
S. Yerly
,
C. Gaille
,
W. Caveng
,
S. Chapalay
,
A. Calmy
(34)
,
A. Signori-Schmuck
(35)
,
P. Morand
(36)
,
L. Bocket
,
L. Mouna
,
S. Ranger-Rogez
,
P. Andre
(37)
,
J. Tardy
(38)
,
M. Trabaud
,
C. Delamare
,
E. Schvoerer
(39)
,
E. André-Garnier
(40)
,
V. Ferre
(41)
,
A. Guigon
,
J. Guinard
,
G. Peytavin
(42)
,
F. Brun-Vezinet
,
S. Haim-Boukobza
,
A. Roques
,
C. Soulie
(43)
,
S. Lambert-Niclot
(44)
,
I. Malet
,
S. Fourati
(45)
,
A.-G. Marcelin
(44)
,
P. Flandre
(46)
,
V. Schneider
(47)
,
C. Amiel
(48)
,
G. Giraudeau
,
S. Fafi-Kremer
(49)
,
M. Schmitt
,
S. Raymond
(50)
,
F. Barin
(4)
,
S. Marque Juillet
1
Service de Virologie [CHU Bichat]
2 Epidémiologie, stratégies thérapeutiques et virologie cliniques dans l'infection à VIH
3 Laboratoire de Virologie [CHU Necker]
4 MAVIVHe - Morphogénèse et antigénicité du VIH, des Virus des Hépatites et Emergents
5 UFR des Sciences de Santé (Université de Bourgogne)
6 CNR virus entériques - Centre National de Référence des virus entériques [CHU de Dijon]
7 Laboratoire de sérologie-virologie (CHU de Dijon)
8 PAM - Procédés Alimentaires et Microbiologiques [Dijon]
9 Service de Virologie [CHU Cochin]
10 Génétique et Ecologie des Virus, Génétique des Virus et Pathogénèse des Maladies Virales
11 CHRU Montpellier - Centre Hospitalier Régional Universitaire [Montpellier]
12 CPTP - Centre de Physiopathologie Toulouse Purpan
13 Laboratoire de Virologie
14 CHU Pitié-Salpêtrière [AP-HP]
15 Centre Hospitalier Universitaire de Rennes [CHU Rennes] = Rennes University Hospital [Pontchaillou]
16 CHU Saint-Antoine [AP-HP]
17 IMRB - Institut Mondor de Recherche Biomédicale
18 Laboratoire de virologie [Rouen]
19 URMITE - Unité de Recherche sur les Maladies Infectieuses et Tropicales Emergentes
20 ECOMERS - Ecosystèmes Côtiers Marins et Réponses aux Stress
21 Service de microbiologie
22 LMGE - Laboratoire Microorganismes : Génome et Environnement
23 MMCS - Modélisation mathématique, calcul scientifique
24 UR 0420 - Station de pathologie végétale
25 CHU Angers - Centre Hospitalier Universitaire d'Angers
26 CHRU Besançon - Centre Hospitalier Régional Universitaire de Besançon
27 MFP - Microbiologie Fondamentale et Pathogénicité
28 LUBEM - Laboratoire Universitaire de Biodiversité et Ecologie Microbienne
29 CRHEA - Centre de recherche sur l'hétéroepitaxie et ses applications
30 Service de Virologie [CHU Caen]
31 Laboratoire de Virologie Humaine et Moléculaire [Caen]
32 CHU Clermont-Ferrand
33 Hôpital Claude Huriez [Lille]
34 HUG - Geneva University Hospital
35 UVHCI - Unit of Virus Host Cell Interactions = Biologie structurale des interactions entre virus et cellule hôte
36 IBCP - Institut de biologie et chimie des protéines [Lyon]
37 LINA - Laboratoire d'Informatique de Nantes Atlantique
38 LEOM - Laboratoire d'électronique, optoélectronique et microsystèmes
39 Service de Virologie [CHRU Nancy]
40 Hôtel-Dieu de Nantes
41 CHU Nantes - Centre Hospitalier Universitaire de Nantes = Nantes University Hospital
42 IAME (UMR_S_1137 / U1137) - Infection, Anti-microbiens, Modélisation, Evolution
43 CRPG - Centre de Recherches Pétrographiques et Géochimiques
44 iPLESP - Institut Pierre Louis d'Epidémiologie et de Santé Publique
45 LPMA - Laboratoire de Probabilités et Modèles Aléatoires
46 Infectious Diseases Department
47 IDES - Interactions et dynamique des environnements de surface
48 ERPCB - Equipe de Recherche en Physico-Chimie et Biotechnologie
49 Laboratoire de Virologie [Strasbourg]
50 MDN - Magnétisme et Diffusion Neutronique
2 Epidémiologie, stratégies thérapeutiques et virologie cliniques dans l'infection à VIH
3 Laboratoire de Virologie [CHU Necker]
4 MAVIVHe - Morphogénèse et antigénicité du VIH, des Virus des Hépatites et Emergents
5 UFR des Sciences de Santé (Université de Bourgogne)
6 CNR virus entériques - Centre National de Référence des virus entériques [CHU de Dijon]
7 Laboratoire de sérologie-virologie (CHU de Dijon)
8 PAM - Procédés Alimentaires et Microbiologiques [Dijon]
9 Service de Virologie [CHU Cochin]
10 Génétique et Ecologie des Virus, Génétique des Virus et Pathogénèse des Maladies Virales
11 CHRU Montpellier - Centre Hospitalier Régional Universitaire [Montpellier]
12 CPTP - Centre de Physiopathologie Toulouse Purpan
13 Laboratoire de Virologie
14 CHU Pitié-Salpêtrière [AP-HP]
15 Centre Hospitalier Universitaire de Rennes [CHU Rennes] = Rennes University Hospital [Pontchaillou]
16 CHU Saint-Antoine [AP-HP]
17 IMRB - Institut Mondor de Recherche Biomédicale
18 Laboratoire de virologie [Rouen]
19 URMITE - Unité de Recherche sur les Maladies Infectieuses et Tropicales Emergentes
20 ECOMERS - Ecosystèmes Côtiers Marins et Réponses aux Stress
21 Service de microbiologie
22 LMGE - Laboratoire Microorganismes : Génome et Environnement
23 MMCS - Modélisation mathématique, calcul scientifique
24 UR 0420 - Station de pathologie végétale
25 CHU Angers - Centre Hospitalier Universitaire d'Angers
26 CHRU Besançon - Centre Hospitalier Régional Universitaire de Besançon
27 MFP - Microbiologie Fondamentale et Pathogénicité
28 LUBEM - Laboratoire Universitaire de Biodiversité et Ecologie Microbienne
29 CRHEA - Centre de recherche sur l'hétéroepitaxie et ses applications
30 Service de Virologie [CHU Caen]
31 Laboratoire de Virologie Humaine et Moléculaire [Caen]
32 CHU Clermont-Ferrand
33 Hôpital Claude Huriez [Lille]
34 HUG - Geneva University Hospital
35 UVHCI - Unit of Virus Host Cell Interactions = Biologie structurale des interactions entre virus et cellule hôte
36 IBCP - Institut de biologie et chimie des protéines [Lyon]
37 LINA - Laboratoire d'Informatique de Nantes Atlantique
38 LEOM - Laboratoire d'électronique, optoélectronique et microsystèmes
39 Service de Virologie [CHRU Nancy]
40 Hôtel-Dieu de Nantes
41 CHU Nantes - Centre Hospitalier Universitaire de Nantes = Nantes University Hospital
42 IAME (UMR_S_1137 / U1137) - Infection, Anti-microbiens, Modélisation, Evolution
43 CRPG - Centre de Recherches Pétrographiques et Géochimiques
44 iPLESP - Institut Pierre Louis d'Epidémiologie et de Santé Publique
45 LPMA - Laboratoire de Probabilités et Modèles Aléatoires
46 Infectious Diseases Department
47 IDES - Interactions et dynamique des environnements de surface
48 ERPCB - Equipe de Recherche en Physico-Chimie et Biotechnologie
49 Laboratoire de Virologie [Strasbourg]
50 MDN - Magnétisme et Diffusion Neutronique
Georges Dos Santos
- Fonction : Auteur
Brigitte Montes
- Fonction : Auteur
- PersonId : 764299
- ORCID : 0000-0003-2866-4274
Jacques Izopet
- Fonction : Auteur
- PersonId : 857751
- ORCID : 0000-0002-8462-3234
- IdRef : 058353887
Jean-Christophe Plantier
- Fonction : Auteur
- PersonId : 1248186
- IdHAL : jean-christophe-plantier
- ORCID : 0000-0001-6417-4083
- IdRef : 10049787X
Jérô Me Guinard
- Fonction : Auteur
Anne-Geneviève Marcelin
- Fonction : Auteur
- PersonId : 759805
- ORCID : 0000-0003-4808-8999
- IdRef : 089079566
Vincent Calvez
- Fonction : Auteur
- PersonId : 11087
- IdHAL : vincent-calvez
- ORCID : 0000-0002-3674-1965
- IdRef : 122596943
Francoise Brun-Vézinet
- Fonction : Auteur
Bernard Masquelier
- Fonction : Auteur
Dominique Costagliola
- Fonction : Auteur
E. Lagier
- Fonction : Auteur
C. Alloui
- Fonction : Auteur
G. Anies
- Fonction : Auteur
P. Pinson-Recordon
- Fonction : Auteur
H. Fleury
- Fonction : Auteur
S. Vallet
- Fonction : Auteur
- PersonId : 837609
- ORCID : 0000-0003-4348-4247
J. Poveda
- Fonction : Auteur
G. dos Santos
- Fonction : Auteur
S. Yerly
- Fonction : Auteur
C. Gaille
- Fonction : Auteur
W. Caveng
- Fonction : Auteur
S. Chapalay
- Fonction : Auteur
L. Bocket
- Fonction : Auteur
L. Mouna
- Fonction : Auteur
S. Ranger-Rogez
- Fonction : Auteur
M. Trabaud
- Fonction : Auteur
C. Delamare
- Fonction : Auteur
E. Schvoerer
- Fonction : Auteur
- PersonId : 172853
- IdHAL : evelyne-schvoerer
- ORCID : 0000-0003-0290-4532
- IdRef : 083596917
A. Guigon
- Fonction : Auteur
J. Guinard
- Fonction : Auteur
F. Brun-Vezinet
- Fonction : Auteur
S. Haim-Boukobza
- Fonction : Auteur
A. Roques
- Fonction : Auteur
S. Lambert-Niclot
- Fonction : Auteur
- PersonId : 916115
I. Malet
- Fonction : Auteur
G. Giraudeau
- Fonction : Auteur
S. Fafi-Kremer
- Fonction : Auteur
- PersonId : 1062952
- ORCID : 0000-0003-3886-7833
- IdRef : 094693501
M. Schmitt
- Fonction : Auteur
S. Marque Juillet
- Fonction : Auteur
Résumé
Objectives: As recommended by the French ANRS programme for the surveillance of HIV-1 resistance, we estimated the prevalence of transmitted drug resistance-associated mutations (RAMs) in antiretroviral-naive, chronically HIV-1-infected patients. Methods: RAMs were sought in samples from 661 newly diagnosed HIV-1-infected patients in 2010/11 at 36 HIVclinical care centres. Weighted analyses were used to derive representative estimates of the percentage of patients with RAMs. Results: At patient inclusion, the prevalence of virus with protease (PR) or reverse transcriptase (RT) RAMs was 9.0% (95% CI 6.8%-11.2%). No integrase RAMs were observed. The prevalences of protease inhibitor, nucleoside RT inhibitor and non-nucleoside RT inhibitor RAMs were 1.8%, 6.2% and 2.4%, respectively. Resistance to one, two and three classes of antiretroviral agent was observed in 7.9%, 0.9% and 0.2% of patients, respectively. The frequency of RAMs was higher in patients infected with B compared with non-B subtype virus (11.9% versus 5.1%, P¼0.003). Baseline characteristics (gender, age, country of transmission, CD4 cell count and viral load) were not associated with the prevalence of transmitted RAMs. However, men having sex with men (MSM) were more frequently infected with resistant virus than were other transmission groups (12.5% versus 5.8%, P¼0.003). Compared with the 2006/07 survey, the overall prevalence of resistance remained stable. However, a significant decrease in the frequency of virus with PR RAMs was observed in 2010/11 compared with the 2006/07 survey (1.8% versus 5.0%, P¼0.003). Conclusions: In France in 2010/11, the global prevalence of transmitted drug-resistant variants was 9.0%, and the prevalence was stable compared with the 2006/07 survey. MSM and B subtype-infected patients are the groups with a higher prevalence of drug resistance.
| Origine | Fichiers éditeurs autorisés sur une archive ouverte |
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