Diagnostic strategy in segmentation defect of the vertebrae: a retrospective study of 73 patients
Mathilde Lefebvre
(1, 2, 3)
,
Anne Dieux-Coeslier
(4)
,
Geneviève Baujat
(5)
,
Elise Schaefer
(6)
,
Saint-Onge Judith
(3)
,
Anne Bazin
,
Lucile Pinson
(7)
,
Tania Attié-Bitach
(5)
,
Clarisse Baumann
(8)
,
Mélanie Fradin
(9)
,
Geneviève Pierquin
(10)
,
Sophie Julia
(11)
,
Chloé Quélin
(9)
,
Bérénice Doray
,
Sylvie Berg
,
Catherine Vincent-Delorme
(12)
,
Laetitia Lambert
(13)
,
Nadine Bachmann
,
Didier Lacombe
(14)
,
Bertrand Isidor
(15)
,
Nicole Laurent
(16)
,
Roume Joelle
,
Patricia Blanchet
(17)
,
Sylvie Odent
(18)
,
Dominique Kervran
,
Nathalie Leporrier
(19)
,
Carine Abel
,
Karine Segers
,
Fabienne Guiliano
,
Emmanuelle Ginglinger-Fabre
,
Angelo Selicorni
,
Alice Goldenberg
,
Salima El Chehadeh
,
Christine Francannet
(20)
,
Bénédicte Demeer
(21)
,
Yannis Duffourd
(3)
,
Christel Thauvin-Robinet
(1, 2, 3)
,
Alain Verloes
(22)
,
Valérie Cormier-Daire
(4)
,
Jean Baptiste Riviere
(3)
,
Laurence Faivre
(1, 2, 3)
,
Julien Thevenon
(23, 1, 2, 3)
1
Centre de génétique - Centre de référence des maladies rares, anomalies du développement et syndromes malformatifs (CHU de Dijon)
2 FHU TRANSLAD (CHU de Dijon)
3 Equipe GAD (LNC - U1231)
4 Service de Génétique Médicale [Lille]
5 Service de Génétique Médicale [CHU Necker]
6 Service de Génétique Médicale [CHU Clermont-Ferrand]
7 Service de génétique médicale [Montpellier]
8 Département de Génétique Médicale
9 Service de génétique clinique [Rennes]
10 Centre de Génétique Humaine
11 Service Génétique Médicale [CHU Toulouse]
12 Centre de Maladies Rares
13 Service de Médecine Infantile III et Génétique Clinique [CHRU Nancy]
14 UB - Université de Bordeaux
15 Service de génétique médicale [CHU Nantes]
16 Service de Pathologie [CHU de Dijon]
17 CHRU Montpellier - Centre Hospitalier Régional Universitaire [Montpellier]
18 IGDR - Institut de Génétique et Développement de Rennes
19 Service de Génétique [CHU Caen]
20 Service de Génétique Médicale, Hôpital Civil, Strasbourg
21 Service de génétique médicale
22 Département de génétique [Robert Debré]
23 Service de génétique et procréation (Grenoble)
2 FHU TRANSLAD (CHU de Dijon)
3 Equipe GAD (LNC - U1231)
4 Service de Génétique Médicale [Lille]
5 Service de Génétique Médicale [CHU Necker]
6 Service de Génétique Médicale [CHU Clermont-Ferrand]
7 Service de génétique médicale [Montpellier]
8 Département de Génétique Médicale
9 Service de génétique clinique [Rennes]
10 Centre de Génétique Humaine
11 Service Génétique Médicale [CHU Toulouse]
12 Centre de Maladies Rares
13 Service de Médecine Infantile III et Génétique Clinique [CHRU Nancy]
14 UB - Université de Bordeaux
15 Service de génétique médicale [CHU Nantes]
16 Service de Pathologie [CHU de Dijon]
17 CHRU Montpellier - Centre Hospitalier Régional Universitaire [Montpellier]
18 IGDR - Institut de Génétique et Développement de Rennes
19 Service de Génétique [CHU Caen]
20 Service de Génétique Médicale, Hôpital Civil, Strasbourg
21 Service de génétique médicale
22 Département de génétique [Robert Debré]
23 Service de génétique et procréation (Grenoble)
Anne Bazin
- Fonction : Auteur
Mélanie Fradin
- Fonction : Auteur
- PersonId : 770262
- ORCID : 0000-0002-2535-2198
Bérénice Doray
- Fonction : Auteur
Sylvie Berg
- Fonction : Auteur
Nadine Bachmann
- Fonction : Auteur
Roume Joelle
- Fonction : Auteur
Dominique Kervran
- Fonction : Auteur
Carine Abel
- Fonction : Auteur
Karine Segers
- Fonction : Auteur
Fabienne Guiliano
- Fonction : Auteur
Emmanuelle Ginglinger-Fabre
- Fonction : Auteur
Angelo Selicorni
- Fonction : Auteur
Alice Goldenberg
- Fonction : Auteur
Salima El Chehadeh
- Fonction : Auteur
- PersonId : 763714
- ORCID : 0000-0003-1613-6570
Christine Francannet
- Fonction : Auteur
- PersonId : 887764
Bénédicte Demeer
- Fonction : Auteur
- PersonId : 1149980
- ORCID : 0000-0001-5266-7710
- IdRef : 083633510
Alain Verloes
- Fonction : Auteur
- PersonId : 757590
- ORCID : 0000-0003-4819-0264
Résumé
Background Segmentation defects of the vertebrae (SDV) are non-specific features found in various syndromes. The molecular bases of SDV are not fully elucidated due to the wide range of phenotypes and classification issues. The genes involved are in the Notch signalling pathway, which is a key system in somitogenesis. Here we report on mutations identified in a diagnosis cohort of SDV. We focused on spondylocostal dysostosis (SCD) and the phenotype of these patients in order to establish a diagnostic strategy when confronted with SDV.Patients and methods We used DNA samples from a cohort of 73 patients and performed targeted sequencing of the five known SCD-causing genes (DLL3, MESP2, LFNG, HES7 and TBX6) in the first 48 patients and whole-exome sequencing (WES) in 28 relevant patients.Results Ten diagnoses, including four biallelic variants in TBX6, two biallelic variants in LFNG and DLL3, and one in MESP2 and HES7, were made with the gene panel, and two diagnoses, including biallelic variants in FLNB and one variant in MEOX1, were made by WES. The diagnostic yield of the gene panel was 10/73 (13.7%) in the global cohort but 8/10 (80%) in the subgroup meeting the SCD criteria; the diagnostic yield of WES was 2/28 (8%).Conclusion After negative array CGH, targeted sequencing of the five known SCD genes should only be performed in patients who meet the diagnostic criteria of SCD. The low proportion of candidate genes identified by WES in our cohort suggests the need to consider more complex genetic architectures in cases of SDV.