Molecular diagnosis of PIK3CA-related overgrowth spectrum (PROS) in 162 patients and recommendations for genetic testing. - Université de Bourgogne
Article Dans Une Revue Genetics in Medicine Année : 2017

Molecular diagnosis of PIK3CA-related overgrowth spectrum (PROS) in 162 patients and recommendations for genetic testing.

Paul Kuentz (1, 2) , Judith Saint-Onge (1, 2) , Yannis Duffourd (1, 2) , Jean-Benoît Courcet (3, 2) , Virginie Carmignac (2) , Thibaut Jouan (1, 2) , Arthur Sorlin (1, 2) , Claire Abasq Thomas (4) , Juliette Albuisson (5) , Jeanne Amiel (6) , Daniel Amram (7) , Stéphanie Arpin (8, 9) , Tania Attie-Bitach (10) , Nadia Bahi-Buisson (6) , Sébastien Barbarot (11) , Genevieve Baujat (6) , Didier Bessis (12) , Olivia Boccara , Maryse Bonniere (10) , Odile Boute (13) , Anne-Claire Bursztejn (14) , Christine Chiaverini (15) , Valérie Cormier-Daire (6) , Christine Coubes (16) , Bruno Delobel (17) , Patrick Edery (18) , Salima El Chehadeh (19) , Christine Francannet (20) , David Genevieve (16, 21) , Alice Goldenberg (22, 23) , Damien Haye (24) , Bertrand Isidor (25) , Marie-Line Jacquemont (26) , Philippe Khau van Kien (27) , Didier Lacombe (28) , Ludovic Martin (29) , Jelena Martinovic (30) , Annabel Maruani (24) , Michèle Mathieu-Dramard (31) , Juliette Mazereeuw-Hautier (32) , Caroline Michot (6) , Cyril Mignot (33) , Juliette Miquel (34) , Fanny Morice Picard (28) , Florence Petit (13) , Alice Phan (35) , Massimiliano Rossi (36) , Renaud Touraine (37) , Alain Verloes (38) , Marie Vincent (25) , Catherine Vincent-Delorme (13) , Sandra Whalen , Marjolaine Willems (16) , Nathalie Marle (1, 2) , Daphne Lehalle (2, 1) , Julien Thevenon (2, 1) , Christel Thauvin-Robinet (1, 2, 3) , Laurence Olivier-Faivre (1) , Pierre Vabres (39, 1, 2) , Jean-Baptiste Riviere (40, 2)
1 Centre de génétique - Centre de référence des maladies rares, anomalies du développement et syndromes malformatifs (CHU de Dijon)
2 LNC - Lipides - Nutrition - Cancer [Dijon - U1231]
3 Service de pédiatrie (CHU de Dijon)
4 CHU - BREST - Hôpital Morvan - CHRU de Brest
5 HEGP - Hôpital Européen Georges Pompidou [APHP]
6 Service de Génétique Médicale [CHU Necker]
7 CHIC - Centre Hospitalier Intercommunal de Créteil
8 CHRU Tours - Centre Hospitalier Régional Universitaire de Tours
9 Service de génétique [Tours]
10 Laboratoire Histologie Embryologie Cytogénétique [CHU Necker]
11 Service de dermatologie [Nantes]
12 CHRU Montpellier - Centre Hospitalier Régional Universitaire [Montpellier]
13 Service de Génétique Médicale [Lille]
14 Service de Dermatologie et Allergologie [CHRU Nancy]
15 Service de Dermatologie [Nice]
16 Département de génétique médicale, maladies rares et médecine personnalisée [CHU Montpellier]
17 GHICL - Groupe Hospitalier de l'Institut Catholique de Lille
18 HCL - Hospices Civils de Lyon
19 Laboratoire de Diagnostic Génétique [CHU Strasbourg]
20 Service Génétique Médicale [CHU Clermont-Ferrand]
21 Cellules Souches, Plasticité Cellulaire, Médecine Régénératrice et Immunothérapies (IRMB)
22 Service de génétique [Rouen]
23 GMFC - Génétique du cancer et des maladies neuropsychiatriques
24 CHU Trousseau [Tours]
25 Service de génétique médicale - Unité de génétique clinique [Nantes]
26 Service de Génétique [CHU La Réunion]
27 CHU Nîmes - Centre Hospitalier Universitaire de Nîmes
28 U1211 INSERM/MRGM - Laboratoire Maladies Rares: Génétique et Métabolisme (Bordeaux)
29 CHU Angers - Centre Hospitalier Universitaire d'Angers
30 AP-HP - Hôpital Antoine Béclère [Clamart]
31 Unité de génétique médicale et oncogénétique [CHU Amiens Picardie]
32 CHU Toulouse - Centre Hospitalier Universitaire de Toulouse
33 CHU Pitié-Salpêtrière [AP-HP]
34 CHU La Réunion - Centre Hospitalier Universitaire de La Réunion
35 CHLS - Centre Hospitalier Lyon Sud [CHU - HCL]
36 CRNL - Centre de recherche en neurosciences de Lyon - Lyon Neuroscience Research Center
37 CHU ST-E - Centre Hospitalier Universitaire de Saint-Etienne [CHU Saint-Etienne]
38 Département de génétique [Robert Debré]
39 Service de Dermatologie (CHU de Dijon)
40 Laboratoire de cytogénétique (CHU de Dijon)
Paul Kuentz
  • Fonction : Auteur
  • PersonId : 994652
Centre de génétique - Centre de référence des maladies rares, anomalies du développement et syndromes malformatifs (CHU de Dijon)
Lipides - Nutrition - Cancer [Dijon - U1231]
Judith Saint-Onge
  • Fonction : Auteur
  • PersonId : 994653
Centre de génétique - Centre de référence des maladies rares, anomalies du développement et syndromes malformatifs (CHU de Dijon)
Lipides - Nutrition - Cancer [Dijon - U1231]
Yannis Duffourd
  • Fonction : Auteur
  • PersonId : 994654
Centre de génétique - Centre de référence des maladies rares, anomalies du développement et syndromes malformatifs (CHU de Dijon)
Lipides - Nutrition - Cancer [Dijon - U1231]
Jean-Benoît Courcet
  • Fonction : Auteur
Service de pédiatrie (CHU de Dijon)
Lipides - Nutrition - Cancer [Dijon - U1231]
Virginie Carmignac
  • Fonction : Auteur
  • PersonId : 994670
Lipides - Nutrition - Cancer [Dijon - U1231]
Thibaut Jouan
  • Fonction : Auteur
  • PersonId : 995276
Centre de génétique - Centre de référence des maladies rares, anomalies du développement et syndromes malformatifs (CHU de Dijon)
Lipides - Nutrition - Cancer [Dijon - U1231]
Arthur Sorlin
  • Fonction : Auteur
  • PersonId : 995277
Centre de génétique - Centre de référence des maladies rares, anomalies du développement et syndromes malformatifs (CHU de Dijon)
Lipides - Nutrition - Cancer [Dijon - U1231]
Claire Abasq Thomas
  • Fonction : Auteur
Hôpital Morvan - CHRU de Brest
Juliette Albuisson
Hôpital Européen Georges Pompidou [APHP]
Jeanne Amiel
  • Fonction : Auteur
  • PersonId : 853872
Service de Génétique Médicale [CHU Necker]
Daniel Amram
  • Fonction : Auteur
Centre Hospitalier Intercommunal de Créteil
Stéphanie Arpin
  • Fonction : Auteur
  • PersonId : 1142830
  • IdRef : 145759997
Centre Hospitalier Régional Universitaire de Tours
Service de génétique [Tours]
Tania Attie-Bitach
  • Fonction : Auteur
  • PersonId : 863592
Laboratoire Histologie Embryologie Cytogénétique [CHU Necker]
Nadia Bahi-Buisson
  • Fonction : Auteur
  • PersonId : 906965
Service de Génétique Médicale [CHU Necker]
Sébastien Barbarot
  • Fonction : Auteur
  • PersonId : 1202886
Service de dermatologie [Nantes]
Genevieve Baujat
  • Fonction : Auteur
  • PersonId : 909513
Service de Génétique Médicale [CHU Necker]
Didier Bessis
  • Fonction : Auteur
  • PersonId : 1015192
Centre Hospitalier Régional Universitaire [Montpellier]
Olivia Boccara
  • Fonction : Auteur
Maryse Bonniere
  • Fonction : Auteur
  • PersonId : 895042
Laboratoire Histologie Embryologie Cytogénétique [CHU Necker]
Odile Boute
  • Fonction : Auteur
Service de Génétique Médicale [Lille]
Anne-Claire Bursztejn
  • Fonction : Auteur
  • PersonId : 789274
  • IdRef : 177203874
Service de Dermatologie et Allergologie [CHRU Nancy]
Christine Chiaverini
Service de Dermatologie [Nice]
Valérie Cormier-Daire
  • Fonction : Auteur
  • PersonId : 902650
Service de Génétique Médicale [CHU Necker]
Christine Coubes
  • Fonction : Auteur
Département de génétique médicale, maladies rares et médecine personnalisée [CHU Montpellier]
Bruno Delobel
  • Fonction : Auteur
  • PersonId : 919148
Groupe Hospitalier de l'Institut Catholique de Lille
Patrick Edery
Hospices Civils de Lyon
Salima El Chehadeh
  • Fonction : Auteur
  • PersonId : 1000106
Laboratoire de Diagnostic Génétique [CHU Strasbourg]
Christine Francannet
  • Fonction : Auteur
  • PersonId : 887764
Service Génétique Médicale [CHU Clermont-Ferrand]
David Genevieve
Département de génétique médicale, maladies rares et médecine personnalisée [CHU Montpellier]
Cellules Souches, Plasticité Cellulaire, Médecine Régénératrice et Immunothérapies (IRMB)
Alice Goldenberg
  • Fonction : Auteur
  • PersonId : 902579
Service de génétique [Rouen]
Génétique du cancer et des maladies neuropsychiatriques
Damien Haye
  • Fonction : Auteur
  • PersonId : 1101001
CHU Trousseau [Tours]
Bertrand Isidor
  • Fonction : Auteur
  • PersonId : 886372
Service de génétique médicale - Unité de génétique clinique [Nantes]
Marie-Line Jacquemont
  • Fonction : Auteur
Service de Génétique [CHU La Réunion]
Philippe Khau van Kien
Centre Hospitalier Universitaire de Nîmes
Didier Lacombe
  • Fonction : Auteur
  • PersonId : 886371
Laboratoire Maladies Rares: Génétique et Métabolisme (Bordeaux)
Ludovic Martin
  • Fonction : Auteur
  • PersonId : 992606
Centre Hospitalier Universitaire d'Angers
Jelena Martinovic
  • Fonction : Auteur
  • PersonId : 910015
AP-HP - Hôpital Antoine Béclère [Clamart]
Annabel Maruani
CHU Trousseau [Tours]
CV
Michèle Mathieu-Dramard
  • Fonction : Auteur
  • PersonId : 941485
Unité de génétique médicale et oncogénétique [CHU Amiens Picardie]
Juliette Mazereeuw-Hautier
Centre Hospitalier Universitaire de Toulouse
Caroline Michot
  • Fonction : Auteur
  • PersonId : 1011437
Service de Génétique Médicale [CHU Necker]
Cyril Mignot
  • Fonction : Auteur
  • PersonId : 902582
CHU Pitié-Salpêtrière [AP-HP]
Juliette Miquel
  • Fonction : Auteur
Centre Hospitalier Universitaire de La Réunion
Fanny Morice Picard
  • Fonction : Auteur
Laboratoire Maladies Rares: Génétique et Métabolisme (Bordeaux)
Florence Petit
  • Fonction : Auteur
  • PersonId : 925162
Service de Génétique Médicale [Lille]
Alice Phan
  • Fonction : Auteur
Centre Hospitalier Lyon Sud [CHU - HCL]
Massimiliano Rossi
Centre de recherche en neurosciences de Lyon - Lyon Neuroscience Research Center
Renaud Touraine
  • Fonction : Auteur
  • PersonId : 925160
Centre Hospitalier Universitaire de Saint-Etienne [CHU Saint-Etienne]
Alain Verloes
  • Fonction : Auteur
  • PersonId : 863600
Département de génétique [Robert Debré]
Marie Vincent
  • Fonction : Auteur
  • PersonId : 1056298
Service de génétique médicale - Unité de génétique clinique [Nantes]
Catherine Vincent-Delorme
  • Fonction : Auteur
Service de Génétique Médicale [Lille]
Sandra Whalen
  • Fonction : Auteur
  • PersonId : 906989
Marjolaine Willems
Département de génétique médicale, maladies rares et médecine personnalisée [CHU Montpellier]
Nathalie Marle
  • Fonction : Auteur
  • PersonId : 995626
Centre de génétique - Centre de référence des maladies rares, anomalies du développement et syndromes malformatifs (CHU de Dijon)
Lipides - Nutrition - Cancer [Dijon - U1231]
Daphne Lehalle
Lipides - Nutrition - Cancer [Dijon - U1231]
Centre de génétique - Centre de référence des maladies rares, anomalies du développement et syndromes malformatifs (CHU de Dijon)
Julien Thevenon
  • Fonction : Auteur
  • PersonId : 964270
Lipides - Nutrition - Cancer [Dijon - U1231]
Centre de génétique - Centre de référence des maladies rares, anomalies du développement et syndromes malformatifs (CHU de Dijon)
Christel Thauvin-Robinet
  • Fonction : Auteur
  • PersonId : 889819
Centre de génétique - Centre de référence des maladies rares, anomalies du développement et syndromes malformatifs (CHU de Dijon)
Lipides - Nutrition - Cancer [Dijon - U1231]
Service de pédiatrie (CHU de Dijon)
Laurence Olivier-Faivre
  • Fonction : Auteur
  • PersonId : 856301
Centre de génétique - Centre de référence des maladies rares, anomalies du développement et syndromes malformatifs (CHU de Dijon)
Pierre Vabres
  • Fonction : Auteur
  • PersonId : 899466
Service de Dermatologie (CHU de Dijon)
Centre de génétique - Centre de référence des maladies rares, anomalies du développement et syndromes malformatifs (CHU de Dijon)
Lipides - Nutrition - Cancer [Dijon - U1231]
Jean-Baptiste Riviere
  • Fonction : Auteur
  • PersonId : 994656
Laboratoire de cytogénétique (CHU de Dijon)
Lipides - Nutrition - Cancer [Dijon - U1231]

Résumé

Postzygotic activating mutations of PIK3CA cause a wide range of mosaic disorders collectively referred to as PIK3CA-related overgrowth spectrum (PROS). We describe the diagnostic yield and characteristics of PIK3CA sequencing in PROS. METHODS: We performed ultradeep next-generation sequencing (NGS) of PIK3CA in various tissues from 162 patients referred to our clinical laboratory and assessed diagnostic yield by phenotype and tissue tested. RESULTS: We identified disease-causing mutations in 66.7% (108/162) of patients, with mutant allele levels as low as 1%. The diagnostic rate was higher (74%) in syndromic than in isolated cases (35.5%; P = 9.03 × 10-5). We identified 40 different mutations and found strong oncogenic mutations more frequently in patients without brain overgrowth (50.6%) than in those with brain overgrowth (15.2%; P = 0.00055). Mutant allele levels were higher in skin and overgrown tissues than in blood and buccal samples (P = 3.9 × 10-25), regardless of the phenotype. CONCLUSION: Our data demonstrate the value of ultradeep NGS for molecular diagnosis of PROS, highlight its substantial allelic heterogeneity, and confirm that optimal diagnosis requires fresh skin or surgical samples from affected regions. Our findings may be of value in guiding future recommendations for genetic testing in PROS and other mosaic conditions

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Soumis le : mardi 11 juillet 2017-15:37:29

Dernière modification le : mercredi 30 octobre 2024-18:17:25

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Dates et versions

hal-01560452 , version 1 (11-07-2017)

Identifiants

Citer

Paul Kuentz, Judith Saint-Onge, Yannis Duffourd, Jean-Benoît Courcet, Virginie Carmignac, et al.. Molecular diagnosis of PIK3CA-related overgrowth spectrum (PROS) in 162 patients and recommendations for genetic testing.. Genetics in Medicine, 2017, 19 (9), pp.989-997. ⟨10.1038/gim.2016.220⟩. ⟨hal-01560452⟩

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